В рамках Яндекс семинаров 14 февраля состоялся доклда Вали Боевой про анализ перестроек раковых геномов. Данная задача, как и большинство задач биоинформатики, является крайне интересной как с прикладной, так и с теоретической точки зрения. Если вам интересны задачи анализа данных или строковые алгоритмы, или вы просто хотите побольше узнать про то, как устроен рак на уровне ДНК клеток, то это доклад для вас.
Аннотация от автора: на то, чтобы впервые прочитать ДНК человека, ушли годы и миллиарды долларов. Сегодня, с помощью технологий, называемых Next Generation Sequencing (NGS), человеческий геном можно секвенировать за несколько дней при себестоимости около десяти тысяч долларов. NGS технологии также стали широко применяться для поиска мутаций и перестроек в раковых геномах. Базируясь на сотнях экспериментов, ученые выявляют ключевые геномные поломки, приводящие к конкретному типа рака. На семинаре будет рассказано про математические методы, которые применяются для обнаружения мутаций в геноме. А именно, методы, использующие NGS данные для поиска точечных мутаций в генах и глобальных перестроек в хромосомах. Для решения этих задач зачастую требуются знания из области дискретной математики, комбинаторики, статистики и теории вероятностей.
cotass 